ミタマのキャラクターストーリーは全1話である。神社の神であるミタマが主人公と夜を待って賽銭泥棒を捕まえ、その正体である病気の母を持つ少女を許す。その後、他の神に頼るのを嫌う気持ちを抑えてアスクレピオスに助けを求める。
賽銭泥棒と神への願い
ミタマは主人公を神社に呼ぶが、用件をなかなか言い出せない。そこへアスクレピオスが参拝に訪れ、自作の不死の治療薬に関わる奇妙な願いを口にする。ミタマは医学の神が神に願い事をするなと叱る。アスクレピオスは、今の自分はレジェンドとして存在しており神の側面はあまりないと答え、神社の作法を調べてから出直すと言って去る。
もう少し優しく接するべきだったと主人公に言われると、ミタマは他の神には絶対に舐められたくないと返す。さらに、最近夜中に賽銭を盗む者がいて苛立っていると打ち明ける。主人公は捕まえる手伝いを申し出て、二人は夜まで待つ。やがて賽銭箱に現れたのは幼い女の子である。少女は盗みを認め、父がおらず、病気の母が働けないこと、金が無いため医者にかかれず食事にも困っていることを語る。
ミタマが怒ったのは盗みそのものより、神社に来ていながら神である自分に願わなかったことである。ミタマは少女の盗みを許し、今後はきちんと参拝して願うよう言い聞かせる。そして母親のことは自分に任せるよう告げる。
頭を下げた神
後日、主人公はミタマに、少女の母の病気が無事に治ったことを伝える。盗んだ賽銭は母が働いて返すという話だったが、ミタマは自分は何もしていないと言って受け取らず、親子の生活費に充てるよう伝える。しかし主人公は、アスクレピオスから事情を聞いていた。
実はミタマはアスクレピオスを探し回って見つけ出し、先日の無礼を詫びたうえで、医学に通じた彼に助けを求めて頭を下げていた。主人公は、他の神に頼ることを嫌っていたミタマがその気持ちを抑えて動いたことを褒め、頭をなでる。ミタマは喜びつつも、子供扱いするなと抗議する。